Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Vmn1r196Q5SVD5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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