Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rtl5Q5DTT4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtl5Q5DTT4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms