Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arap1Q4LDD4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arap1Q4LDD4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms