Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc110Q3V125 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc110Q3V125 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms