Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms