Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nr1d1Q3UV55 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms