Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm29609Q3UU56 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm29609Q3UU56 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm29609Q3UU56 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm29609Q3UU56 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm29609Q3UU56 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm29609Q3UU56 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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