Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxred2Q3USW5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxred2Q3USW5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms