Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usp30Q3UN04 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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