Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmod2Q3UHZ5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmod2Q3UHZ5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms