Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms