Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LbrQ3U9G9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LbrQ3U9G9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms