Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtpbp6Q3U6U5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Gtpbp6Q3U6U5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtpbp6Q3U6U5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms