Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hbq1bQ3U0A6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms