Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn2bQ0KL01 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ubxn2bQ0KL01 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms