Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdf9Q07105 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdf9Q07105 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdf9Q07105 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdf9Q07105 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdf9Q07105 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms