Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr16c6Q05A13 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms