Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Scg2Q03517 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms