Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mc1rQ01727 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mc1rQ01727 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms