Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga4Q00651 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga4Q00651 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms