Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cited1P97769 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms