Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
rp9P97762 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
rp9P97762 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
rp9P97762 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
rp9P97762 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
rp9P97762 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
rp9P97762 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
rp9P97762 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
rp9P97762 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
rp9P97762 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms