Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H3f3aP84244 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms