Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx3P81067 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms