Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ldb1P70662 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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