Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usp9xP70398 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms