Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hoxd13P70217 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd13P70217 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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