Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms