Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms