Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Copz1P61924 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Copz1P61924 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copz1P61924 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms