Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Siah1aP61092 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1aP61092 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms