Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snap25P60879 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms