Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Arpc4P59999 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arpc4P59999 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms