Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rin3P59729 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms