Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tpm2P58774 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms