Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ctdsp1P58466 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms