Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TspoP50637 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TspoP50637 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TspoP50637 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TspoP50637 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TspoP50637 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms