Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FmodP50608 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FmodP50608 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FmodP50608 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FmodP50608 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms