Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Tmod1P49813 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmod1P49813 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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