Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtpreP49446 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtpreP49446 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms