Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms