Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms