Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

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Length 1,068 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pik3caP42337 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pik3caP42337 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pik3caP42337 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms