Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PpargP37238 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PpargP37238 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PpargP37238 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PpargP37238 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PpargP37238 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PpargP37238 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PpargP37238 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PpargP37238 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PpargP37238 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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