Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax3P24610 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms