Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpl13aP19253 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms