Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gata1P17679 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms