Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sptan1P16546 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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