Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RaraP11416 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RaraP11416 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RaraP11416 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RaraP11416 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms