Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntfrO88507 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CntfrO88507 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CntfrO88507 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CntfrO88507 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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CntfrO88507 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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